Das GFZ ist den Zielen verpflichtet, für Chancengleichheit zwischen Frauen und Männern zu sorgen und Frauen gezielt zu fördern. An diesem Vorhaben arbeiten die Gleichstellungsbeauftragte, der Vorstand und die Personalabteilung eng zusammen. Alle vier Jahre wird ein Gleichstellungsplan erarbeitet, in dem alle relevanten Maßnahmen der Förderung von Frauen für die folgende Periode festgehalten werden.
Es gilt, die berufliche Situation von Frauen zu verbessern. Sie sind insbesondere in der Forschung und in Führungspositionen beruflich unterrepräsentiert. Neben der Schaffung von familienfreundlichen Rahmenbedingungen verfolgt das GFZ eine gezielt auf hochqualifizierte Frauen ausgerichtet Personalpolitik. Hierzu gehören neben der Mitgliedschaft im genderdax und der Verfolgung des Kaskaden-Modells die Förderung durch die auf Chancengleichheit ausgerichteten Talent-Management-Instrumente der Helmholtz-Gemeinschaft.