Instrumente zur Probenvorbereitung sind für alle Arten von Proben für Rasterelektronenmikroskope und Transmissionselektronenmikroskope verfügbar.

• Leica EM UC7 Ultramikrotom mit EM FC7 (Kryo-Ultramikrotom)
• Leica EM ACE600 Sputter-Coater
• Vitrobot Mark IV System
• PIPS II System
• Gatan Model 656 Dimple Grinder
• Gatan Model Duo Mill 600
• QATM Qpol 200 M Schleif-/ Poliergerät
• Microsaw MS3
• Leica EM CPD300 Automatisierter Kritisch-Punkt-Trockner
• PELCO BioWave® Pro+ Labormikrowelle
• Leica EM KMR3 Glasmesserbrecher
• Di-Li 905 Stereomikroskop
• andere Geräte für die Negativfärbung